Científics desenvolupen una tècnica per rastrejar l'origen de la covid-19 en 4 hores
Investigadors australians fan una reconstrucció de la història evolutiva del SARS-CoV-2 en els casos en què la font no és clara
Un grup de científics australians ha desenvolupat una tècnica pionera de seqüenciació genòmica, ràpida i de gran precisió, que ajudarà a determinar la font dels casos desconeguts de covid-19 en només quatre hores, publica aquest dijous un estudi.
Els investigadors de la Universitat de Nova Gal·les del Sud (UNSW, sigles en anglès) s'han basat en un mètode britànic de seqüenciació denanoporosper identificar al nou coronavirus, anomenatSARS-CoV-2, en els casos en què la font no és clara mitjançant una reconstrucció de la seva història evolutiva, així com detectar els anomenats super-propagadors.
El temps que actualment retarda la detecció d'un d'aquests casos és d'unes 24 hores a Austràlia, que va sofrir una segona ona de covid-19 a la ciutat de Melbourne entre juny i novembre arran de presumptes errors als centres de quarantena per a viatgers internacionals.
«Quan s'identifica un nou cas 'desconegut' de coronavirus, cada minut compta», ha subratllat l'autor principal d'aquest estudi, IraDeveson, cap del Grup de Tecnologies Genòmiques del Centre de Genòmica Clínica deGarvande laUNSW.
Aquesta nova tècnica consisteix a identificar les variacions genètiques que es produeixen en les transmissions de la covid-19 per establir la relació entre aquells que van contreure el virus, al mateix temps que obre la possibilitat que un futur el rastreiggenòmic es realitzi en temps real, d'acord amb un comunicat de la universitat.
«Cada vegada que el virus de la covid-19 es transmet d'una persona a una altra comet errors de còpia que modifiquen un parell de les 30.000 lletres genètiques», ha explicat RowenaBull, de l'InstitutKirbyde laUNSWi coautora d'aquest estudi publicat a la revista científica NatureCommunications.
El mètode britànic té l'avantatge que no té topalls en la longitud de la seqüenciació dels fragments d'ADN, a més de que dóna la possibilitat de determinar la seqüència completa d'un genoma viral amb major rapidesa, a diferència dels mètodes convencionals que llegeixen fins a 150 lletres per vegada, segons el comunicat de laUNSW.
Davant les preocupacions respecte a l'exactitud d'aquest mètode de seqüenciació denanoporos, els investigadors de laUNSWvan determinar que va ser un 99 precís en la detecció de 157 espècimens de pacients positius deSARS-CoV-2.
Austràlia, on s'ha posat èmfasi en els sistemes de rastreig, acumula des del principi de la pandèmia gairebé 28.000 infeccions, que inclouen 908 morts, la majoria pel rebrot de Melbourne.