Salud
Un estudio internacional desarrolla una tecnología capaz de identificar alteraciones genéticas inductoras del cáncer
La investigación se ha realizado a través del análisis del aumento de copias genéticas en modelos preclínicos organoides
Imagen de archivo del Foso de Hebrón Instituto de Oncología.
Un estudio internacional elaborado por la Universidad de Stanford, la Universidad de Illinois y la Vall de Hebrón Instituto de Oncología (VHIO) ha desarrollado y validado una tecnología capaz de identificar alteraciones genéticas inductoras del cáncer, conocidas como 'dirvers'. La investigación, publicada en la revista 'Cell reportes', se ha basado en la realización de un 'screening computacional' con el objetivo de identificar las amplificaciones en el número de copias genéticas que podían estar relacionadas con la oncogénesis. Este analizó la frecuencia de aparición de estas alteraciones y las correlacionó con los cambios de expresión de los genes.
Los autores de la investigación explican que las células tumorales requieren una o varias alteraciones en su ADN que provocan su división y proliferación incontrolada, que son los renombres 'drivers'. Algunas de estas alteraciones consisten en un incremento en ciertas regiones del genoma del número de copias de ADN. Precisamente, por el hecho de que estas regiones pueden ser muy amplias, en muchos casos no se conoce cuál es el gen que actúa como 'driver' dentro de esta región que puede derivar en el desarrollo de un cáncer.
Así, según han explicado los autores del estudio, los investigadores provocaron amplificaciones del número de copias marcadas con un código de barras mediante la infección de ADN por lentivirus. Posteriormente, dejaron crecer los organoides y se secuenciaron para cuantificar las poblaciones de nada marcados. Cuanto más copias, más probabilidades que este gen sea efectivamente un 'driver'.
Con la aproximación computacional, el estudio permitió reducir el número de nada candidatos a ser 'drivers' oncogénicos en unos 1.000. Entre estos, un subconjunto de 393 nada candidatos se validaron en organoides (modelos tridimensionales de órganos creados en el laboratorio) de ratón y humanos de cáncer de esófago, cavidad oral, colon, estómago, páncreas y pulmón. Así, según los investigadores, los resultados del estudio validan el uso de esta técnica y confirman la identificación de dos nuevos 'drivers' en el cáncer de esófago y en el cáncer de la cavidad oral.
"Utilizando este sistema de códigos de barras y lentivirus pudimos identificar varios oncogenes ya conocidos como CDK4 y CDK6 o KRAS en estos tipos de cáncer validando la nueva metodología" explica al doctor José Antonio Seoane, cabeza del grupo de biología computacional de la Universidad de Illinois. "Además, hemos sido capaces de identificar dos nuevos 'drivers' oncogénicos FGF3 en cáncer de esófago y DYRK2 en cáncer de la cavidad oral".